顺应潮流：仅血红素ctDNA-MRD检测的应用前景！

"转录被不属于MRD测定的实用意义是明确的，希望这些进展将在此之后提高将来MRD测定的机动性。"

前列腺癌的MRD测定是一种灵敏且特异的主要用途出新现异常常前列腺癌病患者尿液里源性核酸（如ctDNA）相对生产量的方式。在这种状态下，病患者无法肉眼可见的鳞状，但确实共存新标准流行病学底片方式未能测定到但就此亦会所致前列腺癌复发的均匀分布鳞状。

MRD，常常称做均匀分布渗入鳞状（Minimal Residual Disease）。适用“Minimal” （均匀分布）这个词汇，是因为它在文献和流行病学学者里更是常常用。不过，“Minimal”这个词汇也许具备“误导性”，因为长期的病变在临床表现和病人决策方面也也许具备不可或缺意义。“Measurable”（可精确测量）一词汇可更是确切地描述渗入在病人体内的免疫系统的共存。NCCN指南同时适用了“Minimal Residual Disease”（均匀分布渗入鳞状）和“Measurable Residual Disease”（可精确测量渗入鳞状）两个名词。

此外，可行性学术研究表明在分子水平上测定多种前列腺癌型式的ctDNA或多或少具备流行病学效用，文献和流行病学学者有时也亦会适用“Molecular Residual Disease”（分子渗入鳞状）一词汇。

近些年，国内外在并不一定里基于ctDNA的MRD评量（ctDNA-MRD）的流行病学原始数据和事实越来越多，带入了并不一定瘤MRD测定的热潮。并不一定瘤ctDNA-MRD测定的系统设计精髓主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（知情比对）

对原发许多组织开展DNA以鉴别病患者的特异基因变异图谱，然后设计聚合酶订制panel或适用固定panel开展个性化的ctDNA测定比对。

2）Tumor-uninformed assays（告知比对）

也可以称做Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即无需原发许多组织，极少依赖于一组预先挑选出新聚合酶/磁性设计的与前列腺癌型式相关的固定panel开展ctDNA测定比对，常常在测定ctDNA凋亡的同时，辅以ctDNA转录或图片组学等多组学方式。弥补了许多组织样本极低或出新现异常常残基极低或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的系统设计战略更是符合社会所的认知，在保证高免疫的先决条件下，可通过出新现异常常多残基的sample-level（样本水平）全面性提高其高频率，系统设计门槛相对来说不是比如说高。Tumor-uninformed assays的系统设计战略更是类似于就有筛，通过提高site-level（残基水平）测定高频率并辅以ctDNA转录或图片组学并紧密缘合数据处理算法全面性提高其高频率和免疫，系统设计门槛相对来说较高。

2021年4年末29日，《Clinical Cancer Research》在线发表了“极少适用尿液ctDNA测定缘直肠癌病患者均匀分布渗入鳞状（MRD）”的文章，首次公开了Guardant Reveal的学术研究原始数据：MRD测定高频率达到91%，免疫达100%，这些推断出新全力支持了极少尿液ctDNA-MRD测定（Tumor-uninformed assays）的潜在流行病学应用领域。

2021年8年末13日，《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流：极少尿液ctDNA-MRD测定的应用领域发展前景”的文章，在这里学术学者们提问评量了极少尿液ctDNA测定MRD的能力，以及将转录导入到ctDNA测定的潜在好处。2

Parikh及其助手1 和Taieb及其助手3 提问了极少尿液ctDNA-MRD测定在缘直肠癌（CRC）病患者里的潜在流行病学应用领域。

▲ ctDNA转录和凋亡在两项学术研究里的应用领域较为（Parikh和Taieb）

缘直肠癌（CRC）的病人依然造成了着一个挑战，即相当多的CRC病患者因中期癌症复发而以致于死亡。尽管流行病学采用了新标准的来开展病人，但高几率IIIC期CRC病患者的5年生存率也极少有53%，究其原因是无法推断出新底片学上并未测定到的均匀分布渗入鳞状（MRD）。4

目前，仍当务之急确切相符哪些病患者术后共存MRD，以鼓励他的学生减小或增加来开展病人，并增加治好的也许性，同时最大限度地减小过多病人的相关毒性。

在过去的几年里，我们对ctDNA在CRC诊断和临床表现里的应用领域有了广泛的了解。目前，基于ctDNA的MRD评量正广泛广泛应用领域前列腺癌的病人里。

ctDNA是由DNA的短图片组合成（大约130-150bp），由免疫系统通过凋亡、坏死或新陈代谢获释到肺脏里。 ctDNA的半衰期较短都因其视作极端的实时负荷遥相呼应，它的共存也许看出新了底片学上看不见的微转移。

在治好性病人缘束后，ctDNA里出新现的体细胞凋亡对随后的底片学复发具备较高的无症状得出结论意义，比如说是当这些凋亡与切除的许多组织里的凋亡相匹配时。测定这种ctDNA判别的MRD可以在I-III期CRC里天内底片学数年末得出结论复发，从而为一组就此亦会复发的CRC病患者提供者一个评量新疗法的窗口。然而，这些ctDNA体制凋亡判别的MRD测定方式的高频率依然是局限的，当务之急改进其测定机动性。

ctDNA的转录测定比不上ctDNA的体制凋亡测定。ctDNA的转录异常常在CRC里更加常常用，并被视为大多数癌变的中期过渡期。这种转录，说明判别为DNA里甲基化的C5位置去除甲基基团，调节周边地区基因的解读，最主要经典的惟恐退行性失活。与体制凋亡相较，CRC里共存更是多的转录异常常区域，为提高MRD测定的高频率提供者了机亦会。SEPT9，就是第一个并用尿液测定单基因转录异常常开展化疗和中期测定CRC的方式。尽管ctDNA转录有这些灵活性，但这些相同的特性也须要谨慎，以保持测定比对的免疫，并尽量减小真无症状的也许性。

在这种背景下，Parikh和Taieb的值得注意最新学术研究缘果为我们对ctDNA机动性的解读提供者了有用的补充，即无需原发许多组织，极少通过尿液ctDNA转录或联合ctDNA凋亡即可开展确切的MRD评量。与其他须要对原发许多组织开展DNA以他的学生近期ctDNA比对的测定不同，值得注意学术研究阐述了Tumor-uninformed assays的合理性，它有几个优势，最主要短时间的TAT，降低初始运输成本，对许多组织极低或不可用的病患者开展出新现异常常。

Parikh等人提供者了一种ctDNA转录紧密缘合ctDNA体制凋亡的固定panel开展MRD的比对评量（NGS方式），与其他零售业上可用的MRD测定方式相较，这种方式不须要切除的许多组织以及订制化。在就此病人后适用时，这种极少尿液ctDNA-MRD测定对复发具备流行病学意义的免疫（100%）和高频率（55.6%），通过导入表型基因构造和交叉出新现异常常比对，其高频率可全面性提高至91%。1 该方式被主要用途正在开展的前瞻性学术研究，最主要他的学生IIA期缘肠癌病人决策的NRG合作组学术研究（NCT04068103）。虽然还须要额外的原始数据集来验证这些推断出新，但这些缘果归功于基于ctDNA的MRD测定在告知的情况下可拒绝接受的测定机动性构造。

Taieb等人的学术研究并用了一对先前被显然是CRC切除后临床表现相关的转录基因记号物WIF1和NPY（ddPCR方式），并将它们广泛应用领域PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验中，将III期CRC病患者随机统称3个年末 vs 6个年末的来开展化疗。在对参予III期试验中的III期CRC病患者开展的首次ctDNA-MRD评量里，有13.8%的病患者术后为ctDNA-MRD无症状，并被认定为单一的临床表现遥相呼应。3 同时，学术学者也指出新，与其他采用NGS方式的ctDNA-MRD学术研究相较，本学术研究里ctDNA的无症状率很低。高频率和PPV或多或少低于NGS测定缘果，ctDNA-MRD无症状和阴性的5年DFS大致相同65%和73%，尽管来开展病人的和不理想的前比对样本解决问题也许亦会对这些缘果产生受到影响。该方式比如说的是其相对单纯，更加低的运输成本和潜在的展现性，不须要零售业测定里所见的专利测定方式。正在开展的前瞻性学术研究将全面性评量极少尿液ctDNA测定是否只能确切评量MRD，以便对CRC病患者开展几率分层，并他的学生来开展病人决策。

无论采用何种方式，极少用尿液ctDNA-MRD测定来他的学生CRC病患者的病人决定，须要可靠且确切的测定方式。需全面性提高极少尿液ctDNA-MRD测定的高频率来相符哪些病患者可以从病人降级里获益，以避免不恰当地选取高危病患者拒绝接受很低风力的病人。Parikh及其助手的学术研究相较之下，导入基因和表型基因以及交叉尿液出新现异常常，可明显提高极少尿液ctDNA-MRD的高频率。相较之下，ctDNA-MRD测定的高免疫对于ctDNA作为一个完整的生物遥相呼应来相符病人追加是至关不可或缺的。由于免疫极低，真无症状的ctDNA-MRD也许亦会使病患者拒绝接受过多的弱化病人。Parikh及其助手的学术研究缘果显然，除体制凋亡外，还可以通过紧密缘合表型基因转录构造的比对来保持免疫。Taieb等人的比对方式的优势在于提高了流行病学构造的高频率和临床表现，但是，正如学术学者承认的那样，实际上的两个基因转录记号也许未能提供者与紧密缘合体制凋亡方式的机动性构造。不可或缺的是，这项指导工作也强调了新标准化比对前条件的不可或缺性，因为各种提取方式可以在很大高度上受到影响ctDNA的得率和相容性。在并未来亦会的学术研究里，这些比对前的考虑将显得越来越不可或缺。

转录被不属于MRD测定的实用意义是明确的，希望这些进展将在此之后提高将来MRD测定的机动性。总之，极少尿液ctDNA-MRD的测定提供者了一个独特的机亦会，适用一种无创方式来探求病人方案，并有也许根除高危病患者的微乳腺癌鳞状。这些学术研究缘果无疑为并未来亦会ctDNA-MRD他的学生的前瞻性流行病学试验中铺平了柏油路。

MRD，依然是一个短时间的发展的领域，我们预计近两年也许亦会出新现新的事实，要么显示出新MRD测定的流行病学效用的局限性，要么显示出新MRD测定的其他优势和新用途。

参考文献：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.